Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00575Q6W349 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00575Q6W349 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms