Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GFI1BQ5VTD9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms