Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01545Q5VT33 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC01545Q5VT33 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms