Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO47Q5MNV8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO47Q5MNV8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms