Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SWI5Q1ZZU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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