Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F4Q16254 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F4Q16254 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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