Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TWIST1Q15672 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms