Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC1AQ14683 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC1AQ14683 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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