Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARB2Q14108 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SCARB2Q14108 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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