Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EXOSC2Q13868 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EXOSC2Q13868 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms