Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
BNIP1Q12981 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNIP1Q12981 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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