Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KCNMA1Q12791 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNMA1Q12791 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
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