Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GCNT1Q02742 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms