Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MS4A2Q01362 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms