Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FAM3BP58499 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM3BP58499 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms