Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NKX2-5P52952 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKX2-5P52952 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms