Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC3P51654 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC3P51654 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC3P51654 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC3P51654 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms