Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRATP43155 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRATP43155 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CRATP43155 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRATP43155 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRATP43155 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRATP43155 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms