Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX3P40426 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX3P40426 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX3P40426 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PBX3P40426 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PBX3P40426 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PBX3P40426 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PBX3P40426 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PBX3P40426 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms