Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD12P35452 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms