Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG3P32926 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSG3P32926 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DSG3P32926 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSG3P32926 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSG3P32926 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
DSG3P32926 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSG3P32926 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSG3P32926 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms