Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LOXP28300 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LOXP28300 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LOXP28300 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LOXP28300 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LOXP28300 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LOXP28300 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LOXP28300 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LOXP28300 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms