Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GCSHP23434 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GCSHP23434 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GCSHP23434 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GCSHP23434 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms