Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2B1P20020 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2B1P20020 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms