Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTPS1P17812 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTPS1P17812 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTPS1P17812 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTPS1P17812 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTPS1P17812 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms