Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD44P16070 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD44P16070 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD44P16070 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD44P16070 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD44P16070 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD44P16070 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD44P16070 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD44P16070 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms