Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF4P15884 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF4P15884 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF4P15884 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF4P15884 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF4P15884 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCF4P15884 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCF4P15884 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCF4P15884 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms