Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MGPP08493 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MGPP08493 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MGPP08493 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MGPP08493 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MGPP08493 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MGPP08493 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms