Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEFMP07197 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEFMP07197 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NEFMP07197 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEFMP07197 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEFMP07197 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEFMP07197 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NEFMP07197 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEFMP07197 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFMP07197 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFMP07197 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFMP07197 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEFMP07197 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEFMP07197 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms