Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTIFO43310 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTIFO43310 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTIFO43310 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTIFO43310 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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