Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCP110O43303 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCP110O43303 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCP110O43303 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCP110O43303 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms