Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN8O00124 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN8O00124 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms