Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC188H7C350 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC188H7C350 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms