Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GMNCA6NCL1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GMNCA6NCL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms