Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms