Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ZNF217-205ENST00000540425 568 ntTSL 36.35□□□□□ -1.392e-9■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.291e-25■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.111e-25■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ATL2-208ENST00000449130 526 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ATL2-207ENST00000443098 775 ntTSL 510.44□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-210ENST00000592115 1141 ntTSL 1 (best)18.18■□□□□ 0.52e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-208ENST00000590925 648 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-204ENST00000586192 524 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-205ENST00000587746 492 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 BIRC5-209ENST00000591800 496 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 MED15-206ENST00000420849 430 ntTSL 314.97□□□□□ -0.011e-9■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 54.07□□□□□ -1.761e-8■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 29.44□□□□□ -0.97e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 SARS-204ENST00000471705 851 ntTSL 26.74□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ERI1-205ENST00000520684 828 ntTSL 521.17■□□□□ 0.986e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ERI1-209ENST00000523898 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 ERI1-201ENST00000250263 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.596e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 CTNNA1-236ENST00000522792 2044 ntTSL 213.48□□□□□ -0.253e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 CTNNA1-223ENST00000520520 484 ntTSL 38.08□□□□□ -1.123e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 SQLE-203ENST00000518931 554 ntTSL 45.3□□□□□ -1.566e-7■□□□□ 10.2
SF3B4Q15427 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 56.17□□□□□ -1.421e-16■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DHX15-209ENST00000513036 1848 ntTSL 25.57□□□□□ -1.521e-16■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DHX15-205ENST00000508368 415 ntTSL 24.77□□□□□ -1.651e-16■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DHX15-203ENST00000504279 761 ntTSL 24.7□□□□□ -1.661e-16■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP2CA-204ENST00000495833 739 ntTSL 27.93□□□□□ -1.142e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP2CA-205ENST00000522385 585 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP2CA-206ENST00000523082 510 ntTSL 43.49□□□□□ -1.852e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 29.24□□□□□ -0.932e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DDX23-209ENST00000551189 587 ntTSL 48.75□□□□□ -1.016e-13■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-207ENST00000538037 631 ntTSL 519.72■□□□□ 0.753e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.633e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 317.91■□□□□ 0.463e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-201ENST00000322060 1206 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.08■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.183e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PCK1-204ENST00000475833 1037 ntTSL 211.89□□□□□ -0.513e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUS1-209ENST00000543754 1378 ntTSL 29.94□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TCP1-207ENST00000536807 873 ntTSL 210.93□□□□□ -0.661e-20■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 RAF1-208ENST00000471449 804 ntTSL 27.51□□□□□ -1.219e-12■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP2R2A-221ENST00000523964 567 ntTSL 43.85□□□□□ -1.794e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP1R12C-205ENST00000588277 419 ntTSL 317.18■□□□□ 0.341e-10■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PPP1R12C-208ENST00000592754 827 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-10■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 ASNS-217ENST00000495255 1678 ntTSL 211.17□□□□□ -0.627e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 RENBP-206ENST00000457282 745 ntTSL 515.47■□□□□ 0.074e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PUM1-215ENST00000525948 1103 ntTSL 39.3□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.318e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 HNRNPK-208ENST00000481820 957 ntTSL 25.28□□□□□ -1.567e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 AAAS-218ENST00000551724 552 ntTSL 412.3□□□□□ -0.448e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 AAAS-210ENST00000548258 550 ntTSL 510.49□□□□□ -0.738e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 BRD8-218ENST00000471892 687 ntTSL 310.18□□□□□ -0.781e-10■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-204ENST00000557840 416 ntTSL 310.31□□□□□ -0.763e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-201ENST00000260359 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.013e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-205ENST00000558123 1934 ntTSL 58.56□□□□□ -1.043e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.223e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.233e-7■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.153e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SIRT7-209ENST00000572671 656 ntTSL 219.89■□□□□ 0.774e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SIRT7-203ENST00000570367 685 ntTSL 218.73■□□□□ 0.594e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-214ENST00000596788 447 ntTSL 318.55■□□□□ 0.561e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-207ENST00000597716 2198 ntTSL 217.4■□□□□ 0.383e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CSK-213ENST00000569462 534 ntTSL 417.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-209ENST00000567291 1110 ntTSL 316.59■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-210ENST00000569610 611 ntTSL 416.59■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-216ENST00000597180 301 ntTSL 516.37■□□□□ 0.211e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-211ENST00000601685 2552 nt16.31■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TNNI3-202ENST00000585806 699 ntTSL 216.25■□□□□ 0.194e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-208ENST00000594387 800 ntTSL 315.91■□□□□ 0.141e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TFR2-203ENST00000461176 692 ntTSL 315.89■□□□□ 0.136e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TNNI3-204ENST00000586669 477 ntTSL 515.84■□□□□ 0.134e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-230ENST00000601809 768 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.011e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 TNNI3-208ENST00000589864 525 ntTSL 215.11■□□□□ 0.014e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.013e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-206ENST00000597354 519 ntTSL 315.08■□□□□ 03e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 ACAP2-211ENST00000480906 1802 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DNAJB4-205ENST00000484662 906 ntTSL 214.57□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 R3HDM2-206ENST00000429355 2266 ntTSL 514.55□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-206ENST00000564006 948 ntTSL 214.52□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 NUTF2-204ENST00000568390 593 ntTSL 314.38□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 IRF3-226ENST00000600453 700 ntTSL 314.38□□□□□ -0.111e-9■□□□□ 10.1
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