Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTDP1Q9Y5B0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTDP1Q9Y5B0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms