Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC12A4Q9UP95 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms