Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNHIT6Q9NWK9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT6Q9NWK9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT6Q9NWK9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms