Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVL1

FAM86C1, Protein FAM86C1, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM86C1Q9NVL1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM86C1Q9NVL1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM86C1Q9NVL1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms