Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPMQ9NSP4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms