Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP4Q9NRJ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
TULP4Q9NRJ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TULP4Q9NRJ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms