Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACSS2Q9NR19 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACSS2Q9NR19 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms