Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRDM10Q9NQV6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRDM10Q9NQV6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms