Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RTN4Q9NQC3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTN4Q9NQC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms