Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLMPQ9H6B4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms