Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLIRPQ9GZT3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLIRPQ9GZT3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms