Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BHLHE41Q9C0J9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms