Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCSER1Q9C0I3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCSER1Q9C0I3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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