Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CARD11Q9BXL7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CARD11Q9BXL7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms